位于马祖列岛的南竿岛马祖港旁边。庙内奉祀海上守护神妈祖，左右陪把千里眼和顺风耳。相传昔日福建湄洲湾孝女林默娘出海救助过不少渔民和商船。一次投海救父，负父尸漂流至南竿岛，死时才28岁，被当地居民厚葬于此并立庙祀奉。庙中央的石方即妈祖的棺木遗迹，为感念此事迹，遂称此岛为“马祖岛”。清康熙时溢封妈祖为天后，因此妈祖庙又称“天后宫”，为当地的信仰中心。每年在农历三月二十三日妈祖诞辰纪念日，迎灵绕境，为马祖列岛民间重要祭典日。