位于马祖列岛的南竿岛上清水村胜利水库对面，为一座红白相间、设计新颖美丽的2层建筑物。在大门前罗列有4座雾炮。该炮座是由东莒岛移来至此，原是为了配合东苫灯塔，在逢浓雾或视线不好时，起辅助指引的功用，以引导海上渔船。同时在大门前罗列的还有闽浙总督的告示石牌、石磨等先民遗物。馆内陈列分为民俗厅、景文厅、振武厅、怀德厅4个展示区。其中民俗厅和景文厅主要陈列历代马祖的文化资产，如服饰、器皿、古币、古花轿等；振武厅以图文资料展示马祖历史沿革。